Dans ce jeu d'adresse, vous devez frayer un chemin aux billes de couleur qui tombent du ciel jusqu'à la vasque afin de la remplir selon l'objectif fixé. Dans Water Werks, vous disposez d'un tuyau d'arrosage afin de propulsez l'eau sur les éléments mobiles du parcours pour les faire bouger et ainsi influencer les mouvements des sphères et réaliser le parcours imposé.