Shelter raconte l'histoire d'un gardien solitaire chargé de surveiller des fantômes centenaires. Mais un jour, il se réveille en sueurs. Il a fait un rêve prémonitoire dans lequel il devait protéger les fantômes d'une destruction imminente. Son rôle est donc de sauver la maison de ceux-ci. Partez donc à l'assaut des ennemis et collectez les crânes magiques pour les détruire.
