Pour qu’un système d’exploitation tel que Windows puisse structurer et retrouver les données stockées sur un disque dur, ce dernier doit être préalablement formaté, c’est-à-dire préparé à recevoir des données.Sur PC, on trouve actuellement deux façons de formater : Fat 32 (File Allocation Table 32 bits) et NTFS (New Technology File System), qui sont les deux systèmes de fichiers les plus utilisés.Le NTFS, apparu avec Windows NT, est plus récent que le Fat 32. Globalement, il est aussi plus performant et sécurisé. Il n’y a qu’à comparer les limites imposées par chaque norme pour s’en rendre compte. Taille maximale d’une partition (C: par exemple) : 32 Go en Fat 32 contre 2 To en NTFS ; taille maximale d’un fichier : 4 Go en Fat 32 contre 2 To en NTFS ; nombre maximal de fichiers : 268 millions en Fat 32 contre 4,3 milliards environ en NTFS… Le système NTFS est donc plus approprié pour les disques durs de grande capacité que l’on trouve aujourd’hui. Côté performances, le NTFS devance aussi son aîné. Il permet la compression des données et réduit le gaspillage du stockage disponible. Grâce à la technologie dite Master File Table (MFT), le NTFS permet une localisation plus rapide des données.Du côté de la sécurité, le NTFS apporte bon nombre d’avantages comme le cryptage, les autorisations d’accès, la gestion des quotas de disques, ou encore la restauration des données grâce à la tenue dun fichier journal. En revanche, pour les petits volumes (moins de 8 Go, comme sur les clés USB ou les petits disques durs), le système Fat32 se montre plus performant. Il assure aussi une meilleure compatibilité avec les systèmes Mac et Linux
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